自由能微扰计算(FEP)是评估药物小分子和靶点结合强度的一种方法。FEP通过在结合态与非结合态之间构建一系列非物理存在的中间态,从而增强采样的可靠性。FEP方法还可以用来计算不同配体与靶点之间的自由能差值。
我们基于FEP流程,与云计算平台深度结合,打造了一套独特的XFEP平台与流程,用于批量完成候选分子与靶点间亲和力的高精度评估,从而在进入小分子与靶点结合活性的湿实验研究之前,有效去除假阳性分子。我们的XFEP基于增强采样算法、严谨的数据统计分析方法、和晶泰科技独有的高精度分子力场(XForce Field)建立。多项前瞻性与回顾性研究显示,XFEP预测值和实验中得到的数据存在显著相关性,官能团替换和骨架跃迁计算上的预测误差(mean unsigned error) 均低于1.0 kcal/mol。XFEP由晶泰科技百万核心的计算平台支撑,利用多云GPU加速,可以在一天内完成数百个分子的XFEP计算,并有效降低计算成本,从而显著提高药物发现成功率,加速新药研发的进程。